Apesar da recente entrada no cenário profissional, o clube já era conhecido nacionalmente pelo trabalho de formação. Ao longo de mais de cinco décadas, revelou atletas que seguiram carreira no futebol brasileiro e em outras modalidades. Entre os nomes ligados ao Uirapuru estão o lateral-direito Lucas Calegari, revelado pelo Fluminense, o zagueiro Jackson, ex-Palmeiras, o atacante Jael “O Cruel”, o nadador olímpico Felipe Lima e a ex-atleta Jorilda Sabino. O meia Kaká também teve uma breve passagem pela escolinha durante a infância.